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“阴阳”思想 解DNA存储难题|大数据研究

滚动 来源:深圳商报      时间:2022-05-05 16:13:47

起源于几千年前的中国古代哲学思想“阴阳”,为今天的大数据研究提供了灵感。4月25日,《自然-计算科学》发表一项来自深圳的最新成果,该研究开创了一套独具优势的“阴阳”编解码系统,用以解决当前DNA信息存储领域的技术难题。

研究由深圳华大生命科学研究院主导,深圳国家基因库、首都师范大学、美国哈佛大学等多个研究团队共同参与。

存储信息,DNA是“资深前辈”

我们正处在前所未有的信息大爆炸时代。据估算,2025年全球每天将产生491EB数据,相当于每天制造出2亿张DVD光盘。如此海量数据,如何长期稳定存储?

2019年,“DNA数据存储器”入选《时代周刊》年度100项最佳发明。

如何用DNA存储数据?华大相关负责人用一句话进行了解释。所有信息在计算机中由二进制的方式存储,即0和1两个数码;而储存在DNA中的生物遗传信息,则以A、T、G、C四种碱基表现。“如果把信息语言的0和1,转换为生物语言的ATGC,DNA就有望成为‘完美’存储器了。”该负责人说。

事实上,在信息存储界,相较于现有的U盘、硬盘、磁带等,DNA可以说是坐拥数十亿年经验的资深前辈。

第一是超高的信息密度,2012年《科学》杂志文章指出,1克DNA理论上可以存储455EB数据,相当于数千万个1TB移动硬盘的大小;第二是超长的待机时间,DNA作为相对稳定的分子,其半衰期长达521年,在理想状态下甚至可保存成千上万年;第三是超强的生物兼容性,DNA作为绝大多数生物遗传信息的载体,相对无机物、金属等存储介质而言,具有更强的生物兼容性。

“阴阳”思想,解DNA存储难题

“DNA的双链模型,是否能如‘阴阳’一样对立、统一和互化?”基于此,研究团队开创了一套名为“阴阳”的比特-碱基编解码系统,验证了该系统在信息密度、技术兼容性、数据恢复稳定性等多方面的优势。

“我们以两套不同的规则,分别对两条二进制信息进行‘一对一’编译转换,再取两者统一交集的部分,实现将两条独立的信息组合统一为一串DNA序列。”华大相关负责人表示。

据悉,目前常用的保存方法分为体内和体外两种模式,两者孰优孰劣尚未形成明确定论。为了全方位验证“阴阳”系统的信息恢复稳定性,华大研究院团队通过体外DNA干粉和细胞体内大片段两种存储环境进行测试,皆实现了原始存储数据的完整恢复。

标签: 存储环境进行测试 资深前辈 自然-计算科学 中国古代哲学思想

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